由于独特的地貌特征和气候条件，落基山脉根据垂直海拔高低被分成三个生态区：山地生态区，亚高山生态区和高山生态区。山地生态区位于峡谷的底部的低山阳坡，其中山地森林主要分布在1200—1800米，典型树种包括道格拉斯冷杉、白云杉和白杨；山地湿地和草地主要分布在河岸周边地区。亚高山生态区分布于1800—2100米高海拔区域的谷地，是落基山脉分布最广泛的生态区类型。高山生态区分布于树线以上区域，即2100—3954米，主要生长身材矮小和顽强的植物，如伏地生长的柳树和矮桦树、石南和莎草。整个公园群内大约有三分之一的区域被裸岩、冰川和永久性冰原覆盖。落基山公园群地区发现有56种哺乳动物，280种鸟类和8种两栖动物。大约有200头棕熊生活在这里，并发现有IUCN红色名录列入濒危的灰狼。

有了山，有了水，再加上植物和动物，以及独特的形态与组合，由此形成绝妙的自然美景：雪山一座连着一座，山顶是皑皑白雪，山与山之间是厚厚的冰川，河流从峡谷奔涌而出，半山腰以下是密绿的森林，森林下面是碧绿的冰川堰塞湖， 它们犹如一串串珍珠，把静静的群山点缀得生气勃勃。