正因为51区的神秘，有关它的各种传言一直没有平息过。一个最广泛的说法是，这是全球唯一一个“外星人基地”，五角大楼在一个被称为“绿屋”的地下冰库保存外星人遗体，以及外星飞船的残骸，每一位新当选的美国总统都会前去参观这些极其珍贵的“外星标本”。

　　附近的许多居民还曾表示，他们曾多次看到51区上空飞过神秘的UFO。以这些传言为基础，好莱坞曾拍摄科幻大片《独立日》，片中威尔·史密斯饰演的地球英雄正是在51区对外星入侵者展开最后一击。

美国现任总统奥巴马参观51区

　　美军辟谣：基地是新型军机试验场

　　如今，中央情报局已开始揭去51区上面的封条，披露在该区上演的被列为高度机密的计划。解密资料显示，51区其实是用来秘密开发新型空军飞行器的一个军事研发基地。

　　据透露，和传统的空军基地不一样，51区内不会入驻普通的人员或设施，在这里工作的都是美国最顶尖的科技人员，他们的研发对象就是最尖端、最新型的军用飞机。如果在这里开发出来的新机种被美空军接纳，这型飞机就会全部被转移到普通的空军基地进行下一步的试飞任务。

　　冷战时期，洛克希德公司主导研发的U-2间谍飞机，据称就是“出产”于51区。洛克希德当时在51区建了临时基地，在几个遮蔽物的掩护下在简易工厂里开始了研发，科研人员下班了就就在拖车房屋里。第一架U-2飞机在1955年8月升空，此后便在CIA指挥之下开始在1956年中期进入苏联上空侦察。

　　此后，51区又陆续出产了一批新型间谍机，比如广为人知的“黑鸟”、F-117“夜鹰”。传言中也是在此完成测试的还包括D-21Tagboard无人驾驶机、小型匿踪垂直起降人员运输机、匿踪巡弋飞弹，以及假想性质的Aurora超音速间谍机。