黑手党论：FBI在肯尼迪之弟、司法部长罗伯特·肯尼迪的领导下打击有组织犯罪活动，据说各主要黑手党头目大为恼火。根据这个推测，黑手党派杰克·鲁比杀死了奥斯瓦尔德，以防他们的阴谋曝光。

　　约翰逊论：按照这个推测，肯尼迪的副总统林登·B·约翰逊想除掉总统取而代之。还有人猜测约翰逊想隐瞒一起腐败丑闻，或者是工业大亨出钱让他杀死肯尼迪，因为他们觉得约翰逊比肯尼迪更能代表他们的利益。

肯尼迪之死各种说法

　　草丘论：可疑的阴影、嫌疑枪手的轮廓、照片和录像上的白烟等致使多年来一直有人怀疑除了李·哈维·奥斯瓦尔德以外还有另外一个枪手。

肯尼迪与嫌疑人李·哈维·奥斯瓦尔德

　　据说有录音资料证明，除了奥斯瓦尔德打出的三枪以外，还有第四声枪响。第四枪应当是从上面射出的，地点是肯尼迪遇刺时所经街道旁的一个小土包。

　　不明飞行物(UFO)论：没有飞碟的阴谋论清单是不完整的。UFO论者声称，肯尼迪遇刺是因为他对外星人太感兴趣，并扬言要公开中情局的秘密计划。