作为“证据”，他们拿出了据说是肯尼迪在遇刺十天前写给中情局的一封信，信中要求查阅关于UFO的秘密文件。据说中情局局长回信称，他无权把那些机密文件交给总统。

　　克格勃论：当时的冷战紧张气氛促使一些人认为，俄罗斯的秘密机构克格勃下令杀死了肯尼迪。

　　枪手奥斯瓦尔德在苏联待过两年，妻子是俄罗斯人，他本人与苏联外交官有来往。至今仍有人推测，克格勃招募了奥斯瓦尔德为其效力，并由他杀死了肯尼迪。

奥斯瓦尔德和其妻子

　　同性恋论：这个推测认为，肯尼迪是被一个心怀嫉妒的同性恋男子杀死的。前新奥尔良地区检察官吉姆·加里森宣称，飞行员戴维·费列是暗杀肯尼迪的主谋。

肯尼迪受人欢迎

　　肯尼迪拥有费列所没有的一切：事业有成、英俊潇洒、受人欢迎、家境富裕、有男子气概。加里森认定，谋划刺杀肯尼迪的是一帮同性恋男子，他们纯粹只是想让总统去死并从中取乐。